差異一：構(gòu)成要件不同

轉(zhuǎn)讓主體、轉(zhuǎn)讓標(biāo)的和轉(zhuǎn)讓條件均不同。在土地轉(zhuǎn)讓中，轉(zhuǎn)讓的標(biāo)的是實體資產(chǎn)，即土地使用權(quán)，轉(zhuǎn)讓的主體是土地使用權(quán)人，即公司法人或自然人，而不是股東。因此構(gòu)成土地轉(zhuǎn)讓行為應(yīng)具備兩個條件：一是土地使用權(quán)發(fā)生了轉(zhuǎn)移，即在原來合法使用基礎(chǔ)上的再次轉(zhuǎn)移;二是土地使用權(quán)轉(zhuǎn)移行為存在于兩個民事主體——土地使用權(quán)人之間，即轉(zhuǎn)讓方、受讓方必須在同一時點同時存在。

差異二：轉(zhuǎn)讓條件不同

以出讓土地使用權(quán)為例，《城市房地產(chǎn)管理法》第三十九條規(guī)定，以出讓方式取得土地使用權(quán)的，轉(zhuǎn)讓房地產(chǎn)時，應(yīng)當(dāng)符合下列條件：(一)按照出讓合同約定已經(jīng)支付全部土地使用權(quán)出讓金，并取得土地使用權(quán)證書;(二)按照出讓合同約定進(jìn)行投資開發(fā)，屬于房屋建設(shè)工程的，完成開發(fā)投資總額的百分之二十五以上，屬于成片開發(fā)土地的，形成工業(yè)用地或者其他建設(shè)用地條件。

差異三：登記部門不同

土地轉(zhuǎn)讓雙方當(dāng)事人應(yīng)依法申請辦理變更土地登記。有限責(zé)任公司股權(quán)發(fā)生轉(zhuǎn)讓的，無需辦理變更土地登記。如果認(rèn)為股權(quán)發(fā)生轉(zhuǎn)讓就必須辦理變更土地登記，那么，只要上市公司的股權(quán)因股票的買進(jìn)賣出而發(fā)生變動，國土資源主管部門就要根據(jù)千變?nèi)f化的股市來實時進(jìn)行土地登記，這顯然是不可行的。

差異四：發(fā)生稅費不同

土地轉(zhuǎn)讓時，發(fā)生的稅費有營業(yè)稅、土地增值稅、所得稅、印花稅、契稅等。股權(quán)轉(zhuǎn)讓時，從稅收上看，現(xiàn)階段主要涉及企業(yè)所得稅或個人所得稅等。從表面來看，似乎股權(quán)轉(zhuǎn)讓的稅負(fù)明顯低于土地轉(zhuǎn)讓，可以規(guī)避土地增值稅等。

差異五：適用法律不同

股權(quán)轉(zhuǎn)讓與土地轉(zhuǎn)讓由不同的法律所調(diào)整。土地轉(zhuǎn)讓受《土地管理法》、《城市房地產(chǎn)管理法》、《物權(quán)法》、《土地管理法實施條例》等一系列與土地轉(zhuǎn)讓有關(guān)的法律法規(guī)所調(diào)整。這些法律、法規(guī)明確規(guī)定了土地轉(zhuǎn)讓的概念、轉(zhuǎn)讓方式及轉(zhuǎn)讓條件。而股權(quán)轉(zhuǎn)讓則適用《公司法》、《證券法》等一系列有關(guān)法規(guī)。