根據(jù)《中華人民共和國發(fā)票管理辦法》(中華人民共和國財政部令第6號)文件的規(guī)定：單位和個人從中國境外取得的與納稅有關的發(fā)票或者憑證，稅務機關在納稅審查時有疑義的，可以要求其提供境外公證機構或注冊會計師的確認證明，經(jīng)稅務機關審核認可后，方可作為記賬核算的憑證。

2、善意取得大頭小尾發(fā)票的正確處理

納稅人有真實交易、善意取得“大頭小尾”發(fā)票的，如果開票方納稅人所在地主管稅務機關回函證明，該發(fā)票確屬開票方自發(fā)售稅務機關購買，且購票方、開具方、業(yè)務交易、收款屬于同一方，實際交易金額與發(fā)票上所列金額一致的，其取得的發(fā)票準予作為稅前扣除的憑據(jù)。

3、貨物品種較多時發(fā)票的開具辦法

一般納稅人銷售貨物或者提供應稅勞務可匯總開具專用發(fā)票。匯總開具專用發(fā)票的，同時使用防偽稅控系統(tǒng)開具《銷售貨物或者提供應稅勞務清單》，并加蓋財務專用章或者發(fā)票專用章。

4、沒有發(fā)票稅前扣除的問題

會計上很多企業(yè)有無據(jù)支出證明入賬，但稅務規(guī)定：企業(yè)實際發(fā)生的與取得收入有關的、合理的支出，包括成本、費用、稅金、損失和其他支出，準予在計算應納稅所得額時扣除比如法院判決企業(yè)支付賠償金，企業(yè)可憑法院的判決文書與收款方開具的收據(jù)作為扣除憑據(jù)，但買東西等沒有發(fā)票，會計可以入賬，稅務不承認。

5、旅行社開具的發(fā)票的風險問題

很多企業(yè)出國考察，需要旅行社提供發(fā)票，到底有沒有風險呢，稅務上風險小，如納稅人發(fā)生出國考察支出，主管稅務機關要求提供證明資料的，應能夠提供證明其真實性的合法憑證，否則，不得在稅前扣除。證明材料應包括：考察人員姓名、地點、時間、任務、支付憑證等。但工商局現(xiàn)在關注，所以不要出現(xiàn)商業(yè)賄賂就可以。

6、專用發(fā)票和普通發(fā)票丟失要不要登報說明

根據(jù)《中華人民共和國發(fā)票管理辦法實施細則》第四十一條規(guī)定，使用發(fā)票的單位和個人應當妥善保管發(fā)票，不得丟失。發(fā)票丟失，應于丟失當日書面報告主管稅務機關，并在報刊和電視等傳播媒介上公告聲明作廢。

根據(jù)《國家稅務總局關于被盜、丟失增值稅專用發(fā)票的處理意見的通知》(國稅函[1995]292號)第二項規(guī)定，為便于各地稅務機關、納稅人對照查找被盜、丟失的專用發(fā)票，減輕各地稅務機關相互之間傳(寄)專用發(fā)票遺失通報的工作量，對發(fā)生被盜、丟失專用發(fā)票的納稅人，必須要求統(tǒng)一在《中國稅務報》上刊登“遺失聲明”。

第三項規(guī)定，納稅人丟失專用發(fā)票后，必須按規(guī)定程序向當?shù)刂鞴芏悇諜C關、公安機關報失。各地稅務機關對丟失專用發(fā)票的納稅人按規(guī)定進行處罰的同時，代收取“掛失登報費”，并將丟失專用發(fā)票的納稅人名稱、發(fā)票份數(shù)、字軌號碼、蓋章與否等情況，統(tǒng)一傳(寄)中國**報社刊登“遺失聲明”。傳(寄)中國**報社的“遺失聲傳(寄)中國**報社的”遺失聲明“，必須經(jīng)縣(市)國家稅務機關審核蓋章、簽注意見。

因此，增值稅專用發(fā)票丟失，必須在《中國稅務報》上刊登“遺失聲明”。而普通發(fā)票丟失，在日常稅務管理中，對開具發(fā)票單位應按《中華人民共和國發(fā)票管理辦法實施細則》第四十一條的規(guī)定在報刊或電視等傳播媒介上公告聲明作廢。即普通發(fā)票丟失，也可在電視等傳播媒介上公告。