1.在證據提取方面存在的問題。重視有罪證據而忽視罪輕、無罪證據。例如有的案件被告人構成自首，但在公訴機關提交的公安機關破案報告中并沒有體現。證據提取不全面。主要是犯罪嫌疑人交待犯罪事實的情況下，偵查人員認為案件已經突破，忽略了其他證據的獲取，導致審判過程中證據形不成證據鏈條，案件的事實無法查清。比如在物證的提取上，有的案件雖然提取了作案工具、犯罪現場被破壞等證據，但對指紋等關鍵物證沒有提取，或未做痕跡對比鑒定。在書證方面，主要是對被告人、被害人的身份證據提取不全面、不及時，存在移送的案卷材料中沒有被告人年齡證明材料等情況。

2.訊(詢)問筆錄方面存在的問題。常見的情況有筆錄首部時間、地點、偵查人員的姓名、被訊(詢)問人的基本情況以及與案件當事人的關系等欄目沒有正確填寫或者填寫不完全，例如只有開始時間，沒有結束時間，或者是結束時間早于開始時間、訊問被告人的時間早于被告人被采取強制措施的時間等，與其他證據內容沖突，給證據的采信造成困難;有的案件幾次訊問筆錄內容完全一致;有的案件一份筆錄中對同一問題多次重復訊問。

3.辨認方面存在問題。一是應做辨認而沒有做辨認。例如，被告人徐某某盜竊一案，被告人徐某某左腳殘疾,而公安機關均未組織同案人對這一明顯身體特征進行辨認;二是辨認時間不及時，待法院審查認為證據不足時，才進行補充辨認，對辨認的效果和對案件的審理均造成影響;三是辨認的程序存在問題，如被辨認人人數少于規定的人數，另有一起案件從被辨認的照片看，犯罪嫌疑人的照片明顯與其他照片不同，只有犯罪嫌疑人的照片是近照，人像較大，其他照片的人像均較小。

4.鑒定方面存在的問題。個別案件的鑒定程序不符合規定。例如石某某等盜竊一案中，公安機關未在犯罪地的物價部門做贓物的價格鑒定,導致辯護人對盜竊價值及價格鑒定程序提出異議。但由于時過境遷，部分贓物已滅失，重新做鑒定不僅困難較大，且鑒定成本也較高，給本案的審理帶來了較大的難度。

(二)審理階段存在的主要證據問題

1.證據采信標準不統一，隨意性大。特別是證據存在瑕疵、證據間出現矛盾的情況下，法官往往偏重于社會整體利益的保護而忽視了對被告人利益的保護，偏重于裁判的正確性而忽略了證據能力和取證程序問題，選擇采用有利于“使有罪的人受到刑法的追究”、“實現打擊犯罪的任務”的證據，不利于被告人權益的保護。

2.庭審對證據的認證流于形式。實踐中筆者感到，刑事案件的庭審過程并沒有真正發揮對證據的質證、認證作用。突出表現為：一是對檢察院提起公訴的案件，經開庭審理后，對證據不足的案件檢察院可以任意補正或者法院會反復退查，這種做法無疑違反了“疑罪從無”的原則;二是有時案件定案的證據超出了公訴機關在法庭上提出的證據范圍，存在偵查、起訴中收集的證據未經庭審質證、認證而在審判時直接作為定案依據的現象。

3.裁判文書對證據方面的論述不足。一個問題是只簡單羅列證據名稱，并不敘述證據的主要內容，能夠證明的內容;另一個問題是采信理由上，只簡單表述為：某某證據本院予以采用、上述事實證據確實充分依法予以認定、某某證據本院不予采信等格式化的語言，但法院采信或不采信的理由和根據是什么并不做論述。

4.對證據的分析、認證能力不足。目前從事刑事審判法官的人員結構狀況和業務素質能力參差不齊，對刑事案件事實的證明要求、證據的認證標準的把握存在困難，對證據的運用、分析能力不足，制約著庭審認證活動的開展，影響案件質量。

分析刑事案件存在上述證據方面問題的原因，主要是：主觀上，辦案人員司法理念落后，證據意識程序意識不強，忽視對當事人合法權利的保護，過分重視“口供”，法官沒有真正擔當中立角色，“無罪推定”和“疑罪從無”原則沒有真正落實;客觀上，辦案人員的業務能力不強、法律知識不足、辦案方法和手段落后;另外，刑事審判制度、運作機制方面存在的缺陷，人、物、財保障方面存在的不足也是造成刑事證據方面問題的因素。