答：參考《鐵路貨物運輸合同實施細則》第十八條規(guī)定，承運人的責任：

一、從承運貨物時起，至貨物交付收貨人或依照有關規(guī)定處理完畢時止，貨物發(fā)生滅失、短少、變質、污染、損壞，按下列規(guī)定賠償：

(一)已投保貨物運輸險的貨物，由承運人和保險公司按規(guī)定賠償;

(二)保價運輸?shù)呢浳铮沙羞\人按聲明價格賠償，但貨物實際損失低于聲明價格的按實際損失賠償;

(三)除上述一、二兩項外，均由承運人按貨物的實際損失賠償。賠償?shù)膬r格如何計算，由鐵道部商國家物價局、國家工商行政管理局另行規(guī)定。

二、由于下列原因之一造成的貨物滅失、短少、變質、污染、損壞，承運人不負賠償責任：

(一)不可抗力;

(二)貨物本身性質引起的碎裂、生銹、減量、變質或自燃等;

(三)國家主管部門規(guī)定的貨物合理損耗;

(四)托運人、收貨人或所派押運人的過錯。

六、如果托運人或收貨人證明損失的發(fā)生確居承運人的故意行為，則承運人除按規(guī)定賠償實際損失外，由合同管理機關處其造成損失部分10%至50%的罰款。

《增值稅暫行條例實施細則》第四條規(guī)定，單位或者個體工商戶的下列行為，視同銷售貨物：

(一)將貨物交付其他單位或者個人代銷;

(二)銷售代銷貨物;

(三)設有兩個以上機構并實行統(tǒng)一核算的納稅人，將貨物從一個機構移送其他機構用于銷售，但相關機構設在同一縣(市)的除外;

(四)將自產或者委托加工的貨物用于非增值稅應稅項目;

(五)將自產、委托加工的貨物用于集體福利或者個人消費;

(六)將自產、委托加工或者購進的貨物作為投資，提供給其他單位或者個體工商戶;

(七)將自產、委托加工或者購進的貨物分配給股東或者投資者;

(八)將自產、委托加工或者購進的貨物無償贈送其他單位或者個人。

第二十四條規(guī)定，條例第十條第(二)項所稱非正常損失，是指因管理不善造成被盜、丟失、霉爛變質的損失。

《增值稅暫行條例》第十條規(guī)定，下列項目的進項稅額不得從銷項稅額中抵扣：

(一)用于非增值稅應稅項目、免征增值稅項目、集體福利或者個人消費的購進貨物或者應稅勞務;

(二)非正常損失的購進貨物及相關的應稅勞務;

(三)非正常損失的在產品、產成品所耗用的購進貨物或者應稅勞務;

(四)國務院財政、稅務主管部門規(guī)定的納稅人自用消費品;

(五)本條第(一)項至第(四)項規(guī)定的貨物的運輸費用和銷售免稅貨物的運輸費用。

《發(fā)票管理辦法》第三條規(guī)定，本辦法所稱發(fā)票，是指在購銷商品、提供或者接受服務以及從事其他經(jīng)營活動中，開具、收取的收付款憑證。

根據(jù)上述規(guī)定，取得的賠償收入，不符合增值稅視同銷售情形，不因開具銷售貨物增值稅發(fā)票給運輸公司，對于收取賠償款開具收款收據(jù)即可。對于運輸過程中發(fā)生非正常損失，需要進行進項稅轉出處理。

《企業(yè)會計準則應用指南》“附錄”會計科目和主要賬務處理規(guī)定：

1901待處理財產損溢

一、本科目核算企業(yè)在清查財產過程中查明的各種財產盤盈、盤虧和毀損的價值。

物資在運輸途中發(fā)生的非正常短缺與損耗，也通過本科目核算。

三、待處理財產損溢的主要賬務處理。

(一)盤虧、毀損的各種材料、產成品、商品、生物資產等，盤虧的固定資產，借記本科目，貸記“原材料”、“庫存商品”、“消耗性生物資產”、“固定資產”等科目。材料、產成品、商品采用計劃成本(或售價)核算的，還應同時結轉成本差異(或商品進銷差價)。涉及增值稅的，還應進行相應處理。

(二)盤虧、毀損的各項資產，按管理權限報經(jīng)批準后處理時，按殘料價值，借記“原材料”等科目，按可收回的保險賠償或過失人賠償，借記“其他應收款”科目，按本科目余額，貸記本科目，按其借方差額，借記“管理費用”、“營業(yè)外支出”等科目。

根據(jù)上述規(guī)定，物資在運輸途中發(fā)生的非正常短缺與損耗，通過“待處理財產損溢”進行會計處理，按可收回的保險賠償或過失人賠償，記入“其他應收款”，差額，記入“營業(yè)外支出”。相關會計分錄如下：

借：待處理財產損益

貸：原材料(庫存商品)

或應交稅費/應交增值稅/進項稅額轉出

借：營業(yè)外支出

其他應收款

貸：待處理財產損益

收到賠償時：

借：銀行存款

貸：其他應收款