另一方面，《刑事訴訟法》應賦予犯罪嫌疑人、被告人變更刑事強制措施的申請權，即應明確規定被采取了刑事強制措施的犯罪嫌疑人、被告人認為公安機關、人民檢察院采取的刑事強制措施不當時，有申請變更的權利。被申請的機關應當組織聽證會，由公安機關的法制部門或者人民檢察院的批捕部門組織，由申請人及其聘請的律師、案件承辦人參加，公安機關的法制部門或者人民檢察院的批捕部門在充分聽取申請方與案件承辦方的意見后，作出是否變更刑事強制措施的決定。

另外，對于逮捕后在羈押期限內發現犯罪嫌疑人另有重要罪行而重新計算偵查羈押期限的，刑事訴訟法應當明確規定仍應報檢察院審查批準，而不應僅由公安機關負責人決定。

2、賦予犯罪嫌疑人、被告人對被超期羈押的申告權，對超期羈押行為進行治罪，以徹底杜絕超期羈押。

《刑事訴訟法》應明確規定，犯罪嫌疑人、被告人被超期羈押的，被羈押的犯罪嫌疑人、被告人及其法定代理人、近親屬、受聘請的律師有權提出申告。如果羈押決定是公安機關作出的，則向人民檢察院申告;如果羈押決定是人民檢察院作出的，則向人民法院申告。人民檢察院、人民法院接到申告后，經審查認為確屬超期羈押的，應即作出決定，要求原決定機關在規定時間內變更強制措施或將犯罪嫌疑人、被告人釋放，原決定機關逾期不執行決定的，人民檢察院或者人民法院有權作出釋放被羈押人的決定。

《刑事訴訟法》還應規定執行羈押任務的看守所監督超期羈押的的職責。羈押期限屆滿前十天，看守所應當書面告知辦案單位，提醒其應在法定期限內辦理延長手續或者變更強制措施。對超期羈押的，看守所應當及時將情況向人民檢察院或者人民法院報告。

為了徹底杜絕超期羈押，筆者認為應當將超期羈押行為明確規定為犯罪。因為超期羈押實際上是未經有權機關或者人員批準的羈押，其實質就是非法拘禁。根據《刑法》第二百三十八條的規定，非法拘禁他人或者以其他方法非法剝奪他人人身自由的，構成非法拘禁罪。由于我國未確定無罪推定原則，也由于我國在刑事訴訟領域對犯罪嫌疑人、被告人人權的輕忽，所以在司法實踐中，公安司法機關及其人員，甚至社會上普遍的觀點均認為，被羈押的人是涉嫌犯罪的人或者是被指控犯罪的人，對這些人即使超期羈押也無礙大局，公安、檢察人員是因辦案而對這些人超期羈押，有時也是無奈，因而并不認為超期羈押行為構成了犯罪。這種認識顯然是錯誤的。如果這種認識邏輯能夠成立，那么，《刑事訴訟法》就不必規定偵查羈押期限，刑訊逼供也同樣不構成犯罪。因此，將超期羈押行為明確規定為犯罪，有利于根絕超期羈押。