刑事訴訟法中的公訴案件和自訴案件，雖然都是刑事案件，但二者之間是有嚴(yán)格區(qū)別的，主要是：

(一)案件來源不同。公訴案件是由國家公訴機(jī)關(guān)即人民檢察院提起的;而自訴案件是由被犯罪行為侵害的公民、個人或者他的法定代理人、監(jiān)護(hù)人、近親屬直接向人民法院提起的。

(二)犯罪性質(zhì)和危害程度不同。公訴案件中犯罪行為的性質(zhì)一般來說比較嚴(yán)重，對社會的危害性也比較大，案件一經(jīng)起訴人民法院必須依法進(jìn)行審判，除公訴機(jī)關(guān)認(rèn)為所指控的事實不清，證據(jù)不足，不能對被告人定罪和處以刑罰申請撤回起訴，人民法院準(zhǔn)許撤回起訴外，人民法院必須依據(jù)審理中查明的事實和證據(jù)，依法作出有罪或無罪判決。而自訴案件犯罪行為的性質(zhì)多數(shù)不甚嚴(yán)重，對社會的危害性也比較小，因而，自訴人在判決宣告前可以同被告人自行和解或撤回自訴，對告訴才處理和有證據(jù)證明的輕微刑事案件，可以進(jìn)行調(diào)解。

(三)審查程序不同。與庭審方式改革相適應(yīng)，現(xiàn)行刑事訴訟法弱化了公訴案件進(jìn)行庭前審查的實體內(nèi)容，基本上實行程序性審查，即審查只要符合“起訴書中有明確的指控犯罪事實并且附有證據(jù)目錄、證人名單和主要證據(jù)復(fù)印件或照片的”，人民法院就應(yīng)當(dāng)決定開庭審判，審查的主體是負(fù)責(zé)該案審理的審判組織成員;而自訴案件則應(yīng)經(jīng)二次審查，第一次是立案前的程序?qū)彶?，審查是否符合立案?biāo)準(zhǔn)，根據(jù)立、審分立的原則，審查的主體應(yīng)是專門審查立案的人員。第二次審查是開庭前的實體審查，審查是否符合“犯罪事實清楚，有足夠證據(jù)”這一開庭審理的必備條件，符合開庭審理條件的應(yīng)轉(zhuǎn)到開庭審理程序，不符合開庭審理條件的，應(yīng)說服自訴人撤回自訴或裁定駁回起訴，審查的主體是負(fù)責(zé)該案審理的審判組織人員。

(四)當(dāng)事人的訴訟權(quán)利不完全相同。如：1、自訴案件的被告人及其法定代理人在訴訟過程中有權(quán)提起反訴;而公訴案件的被告人及其法定代理人雖然有權(quán)對司法人員侵犯其訴訟權(quán)利提出控告，但絕不能就案件事實本身對司法人員提出反訴;2、自訴案件的被害人作為自訴人如果對地方各級人民法院第一審判決或裁決不服的，有權(quán)在法定上訴期內(nèi)按照法定程序向上一級人民法院提出上訴，享有獨(dú)立的上訴權(quán);而公訴案件的被害人沒有獨(dú)立的上訴權(quán)，無權(quán)對地方各級人民法院第一審判決或裁定提出上訴，只能自收到判決書五日以內(nèi)，請求人民檢察院在法定期限內(nèi)按照法定程序提起抗訴。

(五)當(dāng)事人的訴訟地位不同。自訴案件中的被害人是自訴人，居原告地位，而公訴案件中公訴機(jī)關(guān)(人民檢察院)居原告地位，被害人則處于證人地位。

(六)當(dāng)事人行使訴訟權(quán)利的時間不同。

1、公訴案件自案件移送審查起訴之日起，犯罪嫌疑人有權(quán)委托辯護(hù)人;而自訴案件的被告人隨時有權(quán)委托辯護(hù)人;

2、公訴案件的被害人及其法定代理人或者近親屬，附帶民事訴訟的當(dāng)事人及其法定代理人，自案件移送審查起訴之日起，有權(quán)委托訴訟代理人;而自訴案件的自訴人及其法定代理人，附帶民事訴訟的當(dāng)事人及其法定代理人，有權(quán)隨時委托訴訟代理人。

(七)舉證責(zé)任不同。自訴案件的舉證責(zé)任規(guī)定為完全由自訴人承擔(dān)，對于缺乏證據(jù)的自訴案件，人民法院有權(quán)限期自訴人補(bǔ)充證據(jù)，如果自訴人提不出補(bǔ)充證據(jù)，人民法院又無法調(diào)取和收集到必要的證據(jù)，應(yīng)說服自訴人撤回訴訟，或者裁定駁回訴訟;而公訴案件的被害人只是就自己遭受犯罪行為直接侵害的事實和有關(guān)犯罪嫌疑人的情況向司法機(jī)關(guān)如實進(jìn)行陳述和控告，至于收集和核對案件事實和證據(jù)以及查獲犯罪嫌疑人是司法機(jī)關(guān)應(yīng)盡的職責(zé);被告人也沒有證明自己有罪和無罪的責(zé)任，司法機(jī)關(guān)只有依照法定程序收集到確實充分的證據(jù)，才能對被告人提起訴訟和處以刑罰，由此可見，公訴案件的舉證責(zé)任完全由公訴機(jī)關(guān)承擔(dān)。

(八)刑罰處罰的輕重不同。自訴案件的刑罰處罰，一般都在三年以下有期徒刑、拘役或管制;而公訴案件的刑罰處罰可達(dá)十年以上有期徒刑、無期徒刑直至死刑。

(九)案件的可分性特點不同。自訴案件中的一個犯罪行為侵害了數(shù)個人的利益，受害人不只一人，而是數(shù)人，在這種情況下，其中任何一個受害人都有權(quán)單獨(dú)向人民法院提出控訴，沒有提起控訴的受害人，有權(quán)放棄訴訟。如果是數(shù)人共同對某一人實施某一犯罪行為，受害人有權(quán)對其中的一人或幾人提起控訴，兩種情形不管屬于哪一種情形，受害人的控訴均應(yīng)視為有效，不受限制;但公訴案件的情況恰恰相反，它具有一案不可分的特點，即一個被告人犯了數(shù)罪，或共同犯罪案件中的所有被告人，都必須一案審理，不能“一罪一審”或“一人一審”。

(十)審理期限的要求不同。根據(jù)刑事訴訟法第一百六十八條的規(guī)定，人民法院審理公訴案件應(yīng)當(dāng)在受理后一個月內(nèi)宣判，至遲不得超過一個半月。重大的犯罪集團(tuán)案件、流竄作案的重大復(fù)雜案件及交通十分不便的邊遠(yuǎn)地區(qū)的重大復(fù)雜案件等，在上述期限內(nèi)不能辦結(jié)的，經(jīng)省、直轄市、自治區(qū)高級人民法院批準(zhǔn)或決定，審理期限可延長一個月。根據(jù)《解釋》第一百零九條的規(guī)定，適用普通程序?qū)徖淼谋桓嫒肆b押的自訴案件的審理期限、延長審理期限的理由、批準(zhǔn)或決定延長審理期限的機(jī)關(guān)及可延長的期限和公訴案件一致;但適用普通程序?qū)徖肀桓嫒宋幢涣b押的自訴案件，應(yīng)當(dāng)在立案后六個月內(nèi)宣判，有特殊情況需要延長審理期限的，由本院院長批準(zhǔn)，可以延長三個月。