一、職能轉變
　　司法部擔負執行刑罰、管理勞動教養、法律服務和法制宣傳教育等司法行政任務。
　　強化的職能主要有：研究制訂司法行政工作的發展戰略、規劃和方針、政策、法規，宏觀管理全社會法律服務事業，指導行政機關、企事業單位法律顧問工作，研究司法領域人權問題，組織和指導全國法學教育和普法宣傳工作等。
　　轉移或下放的職能主要有：減少具體事務性工作，將勞改勞教單位基本建設項目的論證、評估、審查工作和公證員、律師資格考試前期準備工作等，轉移到有關事業單位；減少部直接管理干部的數量，不再直接管理企事業單位的具體事務。

　二、主要職責
　　司法部是國務院主管全國司法行政工作的職能部門，主要職責是：
　　（一）制訂司法行政工作的方針、政策、法規，編制司法行政工作的中長期規劃、年度計劃并監督實施。
　　（二）監督和指導全國監獄執行刑罰、改造罪犯的工作，管理部直屬監獄。
　　（三）監督和指導全國的勞動教養工作。
　　（四）制度全國法制宣傳教育和普及法律常識規劃并組織實施，指導各地區、各行業的依法治理工作，指導對外法制宣傳工作。
　　（五）監督和指導全國的律師工作和法律顧問工作，綜合管理社會法律服務機構和在華設立的外國（境外）律師機構。
　　（六）監督和指導全國公證機構和公證業務活動，負責委托港澳地區公證律師辦理公證事務。
　　（七）指導全國的人民調解和司法助理員工作。
　　（八）管理部直屬的高等政法院校，指導全國的中等、高等法學教育工作和法學理論研究工作。
　　（九）組織參加聯合國有關預防犯罪領域的會議和活動，承辦聯合國有關對口部門的往來業務，組織參加國際有關人權問題的法律研討和交流活動，開展政府間的法律交流與合作。
　　（十）參加與外國簽訂司法協助協定的談判，負責國際司法協助協定執行的有關事宜。
　　（十一）參與國家立法工作，參與制訂有關港澳臺地區的法規，組織司法領域人權問題研究。
　　（十二）監督大型監獄、勞動教養場所國有資產的保值增值，管理直屬單位的國有資產。
　　（十三）指導全國司法行政系統的隊伍建設和思想政治工作，協助省、自治區、直轄市管理司法廳（局）領導干部。

　三、內設機構
　　根據上述職責，司法部設１２個職能司局和政治部（含兩個司局級機構和機關黨委工作機構）。
　　（一）辦公廳
　　負責部機關重大政務活動的組織實施和檢查落實，協助部領導組織機關日常工作，協調各司局間的工作關系，負責綜合性文件、報告的起草。研究制訂司法行政工作發展戰略和中長期規劃、年度計劃，負責政務信息、新聞發布、文秘、信訪、統計、檔案管理、機關保衛等工作。
　　（二）監獄管理局
　　指導全國監獄執行刑罰和獄政管理工作，監督檢查國家監管改造罪犯的法律、法規和政策的執行情況，規劃全國監獄的布局，掌握重要罪犯和省際之間的調犯工作，指導對罪犯的教育和改造工作，組織司法領域人權問題的研究，指導全國監獄的生產、基建、裝備、財務和工人管理工作并監督其國有資產的保值增值，管理部直屬監獄。
　　（三）勞動教養工作管理局
　　指導全國的勞動教養工作，監督檢查國家勞動教養法律、法規和政策的執行情況，指導對勞教人員的管理、教育、警戒等工作，規劃全國勞教場所的布局，指導勞教生產、基建、財務、裝備工作。
　　（四）法學教育司
　　組織制訂全國法學教育的具體政策和規章制度，制定法學教育和在職政法干部、企業法律顧問培訓規劃并組織實施，管理和指導部直屬高等政法院校，對全國高、中等法律院校及成人法律院校的法學教育工作進行業務指導。
　　（五）法制宣傳司
　　負責全國的法制宣傳教育工作，組織實施在全體公民中開展普及法律常識教育的工作，指導各地區、各行業的依法治理工作，指導對外法制宣傳工作。
　　（六）律師司
　　監督、指導全國的律師工作和行政機關、企事業單位的法律顧問工作，綜合管理社會法律咨詢服務機構和在華設立的外國（境外）律師機構。
　　（七）公證司
　　指導、監督全國公證機構的公證業務活動，負責委托港澳地區公證律師辦理公證事務，開展與外國和港澳臺地區公證組織、人員的業務交流與合作，指導和監督中國收養組織的工作。
　　（八）基層工作司
　　指導全國司法助理員工作及有關基層司法行政工作，指導人民調解和基層法律服務工作，研究制訂有關政策、法規并檢查貫徹執行情況。
　　（九）外事司
　　組織參加聯合國預防犯罪和刑事司法領域的會議和活動，承辦聯合國有關對口部門的往來業務，組織參加有關司法、法學領域的多邊或雙邊活動，研究各國的司法制度和司法實踐。
　　（十）司法協助局
　　參加與外國簽訂各種有關司法協助條約的談判，歸口管理司法協助協定的執行事宜，組織對外國法律的研究。
　　（十一）法制司
　　組織協調起草司法行政法律、法規和規章，對有關法律、法規草案提出意見，指導地方司法行政機關法制建設和行政復議、應訴工作，組織有關法律、政策調研工作，進行港澳臺地區法律問題研究，負責涉臺法律事務。
　　（十二）計財司
　　管理部和直屬單位的行政和事業經費，管理部機關和直屬單位的國有資產及基本建設投資，宏觀管理全國司法行政系統的裝備和勞改勞教基本建設投資。
　　（十三）政治部（含兩個司局級機構和機關黨委工作機構）
　　指導全國司法行政系統的思想政治工作和黨的建設，管理部機關和直屬單位的人事工作，協助有關部門管理司法行政系統的編制工作，協助省、自治區、直轄市管理司法廳（局）領導干部，管理全國司法行政系統的警務工作。

　四、人員編制和領導職數
　　司法部機關行政編制為４１７名。其中，部長１名，副部長４名；司局級領導職數４５名（含政治部司局級領導職數）。
　　紀檢、監察、審計等派駐機構和后勤、老干部服務機構及編制，按有關規定另行核定。