一、組織領導
　　１．國家中醫管理局中醫古籍整理出版辦公室（以下簡稱中古辦），負責制定全國中醫古籍文獻研究整理出版規劃，下達任務、組織落實，掌握全國中醫古籍出版動態，協調各有關出版部門的中醫古籍出版事宜，處理日常工作。
　　２．國家中醫管理局設立中醫古籍文獻研究整理出版學術委員會（以下簡稱中古委），聘請學術造詣較深、專業水平較高、治學嚴謹、作風正派的專家擔任學術委員。學術委員會承擔課題審議、成果評定、顧問咨詢等項任務。
　　３．各省市中醫古籍文獻研究整理的組織領導、任務落實、經費分配、成果評定管理工作，由省市衛生廳中醫處（或省中醫古籍整理辦公室）負責。
　　４．省市衛生廳應成立由３－５名學有專長、具有一定學術水平、熟悉本專業的人員組成的“中醫古籍文獻研究整理評審組”，負責業務指導、樣稿審定、成果評議等事宜。

　二、專業機構
　　１．各級中醫古籍文獻研究所（室），是主要承擔中醫古籍文獻研究整理任務的專業機構。
　　２．凡有條件的省市、中醫學院、中醫研究院（所），均應設立中醫古籍文獻研究整理的專業機構，各級中醫主管部門應給古籍文獻研究所（室）創造必要的條件，人員要相對穩定并列入科研編制，促使其較快地鞏固和發展。

　三、專業隊伍
　　１．從事中醫古籍文獻研究整理專業人員的技術職務，隨所在單位科技人員的專業技術職務聘任。兼職人員承擔并完成的古籍文獻研究整理任務，應計算工作量，作為考核或聘任專業技術職務的參考。
　　２．從事中醫古籍文獻研究整理工作的專業人員的技術職務，應以其專業水平、實際工作能力、工作成績為主要條件進行評定。
　　３．從其它專業改作中醫古籍文獻研究整理工作的專業人員，其專業技術職務的重新評定，參照有關規定辦理。

　四、任務分配
　　１．中醫古籍文獻研究整理出版任務的分配及課題安排和調整，由中古辦負責。
　　２．課題類別與目的要求，由中古委提出評議意見，中古辦審定。
　　３．中古辦負責將列入規劃的選題項目、要求等分批下發給各有關單位。應標單位或個人需按《中醫古籍文獻研究整理出版合同書》（試行）的要求認真填寫，重點課題應進行開題論證，三類書只寫出整理計劃和簡短樣稿，由省衛生廳中醫處核簽后一式四份上報中古辦（簽后合同書，中古辦、出版單位、省衛生廳中醫處和承擔單位各備案一份）。
　　４．中古委負責對各應標單位及課題承擔人的實際水平、有利條件和不利因素進行衡量比較，提出評審意見，由中古辦選定，報批后下達。
　　５．中古辦負責與中標單位及課題承擔人簽定合同書。合同書由該課題承擔者及所在單位和上級主管部門分別簽署意見，并與編輯出版單位簽定合同。
　　６．凡本辦法正式行文試行之日起未完成的重點課題，均需補辦合同手續。
　　７．承擔任務的單位或個人未按合同規定時限、質量等要求完成任務者，根據具體情況，由中古辦會同中古委決定退回修改或收回任務另行分配。

　五、成果評定
　　１．中醫古籍文獻研究整理，是中醫科學研究工作的重要組成部分。凡列入衛生部“中醫古籍整理出版規劃”，完成并達到整理出版要求的課題，可按逐級上報的程序、成果的隸屬關系申請并參加科研成果評定。
　　２．中醫古籍文獻研究整理成果的評定，應按分級管理、同行評議的原則，由各級科技、中醫行政部門組織本專業的專家審定。
　　３．對已評定的各級科研成果，其課題承擔單位或個人，可以分別給予相應的榮譽及物質獎勵。

　六、經費來源
　　按照部、省、院（所）三級科研管理程序，中醫古籍文獻研究整理出版經費主要來源于以下幾個方面：
　　１．國務院、國家中醫管理局撥給中古辦的中醫古籍文獻研究整理專項補助經費或科研經費。
　　２．各省市用于中醫古籍文獻研究整理的專項經費和科研經費。
　　３．各中醫學院、中醫研究院（所）及有關單位的事業費。
　　４．各出版部門按合同規定提交的利潤提成費。

　七、經費用途
　　中古辦掌握的中醫古籍文獻研究整理專項補助經費主要用于以下幾項：
　　１．辦公室建設及管理經費。
　　２．補助全國重點專業機構的開辦費。
　　３．一類課題的重點資助費、二類課題及難度較大的三類課題的補貼費。
　　４．全國性學習班、講習班和研究班的教學費用補貼。
　　５．學術委員會業務活動經費。
　　６．部級全國綜合課題論證、成果評審、審稿活動費。
　　７．會議經費。
　　８．虧損性中醫古籍文獻的出版補貼費。
　　９．簡報費、雜志補助費。
　　１０．各省市衛生廳（局）、中醫學院、中醫研究院（所）劃出的專業經費，應參照上述原則辦理。

　八、經費使用
　　１．中醫古籍文獻研究整理的課題經費由課題負責人掌握使用。
　　２．中醫古籍文獻研究整理經費必須專款專用，要本著勤儉節約的原則，杜絕不正當的開支。
　　３．不屬于承擔單位方面的原因而中途撤題者，原發經費及預支稿費不退，未預支稿費者應視課題進展程度，發給相當于稿酬３０％－５０％的勞務資料費；屬于承擔單位方面的原因者，原發經費及預支稿費如數退回。

　九、其它
　　１．本辦法自正式行文之日起試行。
　　２．本辦法的解釋權屬中古辦。