一、改革的原則和指導思想
　　為適應社會主義市場經濟體制，中國社會科學院要進一步深化管理體制改革，調整學科布局和科研力量的配置；擴大研究所自主權，增強研究所的活力，提高工作效率；強化激勵機制和競爭機制，完善課題責任制、重點項目成果鑒定、業績考核、優秀科研成果評獎、專業技術職務評聘等科研、人事管理制度；下放干部管理權限，減少院直接管理干部的數量；實行工資總額宏觀管理；切實按照服務職能與管理職能分開的原則，精簡管理機構和編制。通過改革達到合理布局、精簡機構、提高效率、多出成果、多出人才的目的。

　二、主要職責
　　（一）根據我國經濟、社會發展的要求及黨和國家的有關方針、政策，確定本院各項工作的方針和任務，制定具體辦法和規章制度并組織實施。
　　（二）根據我國國情和經濟、社會發展戰略以及國際學術發展動向，制定本院科研規劃；負責組織重大問題的調研，組織院屬單位承擔并完成國家重點科研項目。
　　（三）向黨中央和國務院報送學術研究和思想理論方面的重要信息，反映學術界動態，報送本院重要研究成果、對策性建議等。
　　（四）根據我國對外政策和社會科學發展的需要，制定本院國際學術交流規劃并負責組織實施；組織本院對臺灣和港澳地區的學術交流工作。
　　（五）提出院屬局級研究所機構設置、領導干部職數以及全院總編制數的意見，報國務院審批；根據管理權限，對院屬單位的干部實行分類管理。
　　（六）承擔黨中央和國務院交辦的其他工作。

　三、內設機構
　　（一）辦公廳
　　協助院領導進行綜合、協調、督促、檢查工作，代表院處理對外聯系事宜；負責各項計劃的綜合與統計工作；負責會議組織、文電處理、秘書事務、檔案管理、機要保密、信訪接待、提案辦理和對外新聞宣傳等工作；向黨中央、國務院及時報送學術研究和思想理論方面的重要信息；負責編輯院《要報》和《中國社會科學院通訊》，承擔有關調研任務。
　　（二）科研局
　　負責編制院年度及中長期科研規劃，組織重大科研項目的實施；掌握科研動態，對研究方向、研究任務、研究機構的調整和設置提出建議；審核院屬研究機構學術活動計劃，組織重要科研成果的鑒定和評獎；組織全院性或跨學科的學術活動和學術會議，參與高級專業技術職務評聘及對外學術交流計劃的制定和重要項目的審議，參與院學位管理工作；掌握院重點項目經費的分配和使用，管理院學術著作出版基金；負責院屬各類學會、研究會、基金會的管理；審核院學術刊物的創辦、調整、年檢等工作，編輯《學術動態》、《社會科學管理》刊物；負責科研業務的院外聯系和科研成果的宣傳工作。
　　（三）人事教育局
　　負責擬定院人事工作的規章制度和具體辦法；受院黨委委托負責院機關各部門及院屬單位的領導班子、后備干部隊伍建設和局、處級干部的管理；負責全院職工的錄用、調配、考核、任免、晉升、獎懲、工資、福利、勞保、離休退休、出國政審、落實政策等方面的工作；負責人事檔案及人事信息系統的工作；負責全院機構設置、人員編制、工資總額、人員計劃的制定工作；負責專業技術人員的職務評聘、管理和優秀科研人才的選拔；負責博士后流動站的管理工作；指導人才交流；負責在職人員的培訓、繼續教育和專業技術人員的職務晉升考試。
　　（四）外事局
　　負責擬定院國際合作交流的規章制度和具體辦法；負責全院對外學術交流活動的規劃、項目審議及組織實施工作；組織、協調全院外事工作，管理有關檔案資料并及時提供利用；承辦院級對外學術交流具體事務；負責協調全院對臺灣和港澳地區學術交流工作。
　　（五）保衛局
　　負責制定院各項安全保衛工作的規章制度，加強政治保衛工作；檢查、監督院屬單位的安全保衛工作；協調指導全院內部安全管理，預防和處理各類刑事、治安事故；負責消防監督、檢查；配合國家執法機關查處有關重大案件和事故；做好重要會議的保衛工作。
　　（六）財務基建計劃局
　　負責全院資產、資金的計劃管理，編制財務計劃、設備購置計劃、基本建設中長期及年度計劃、房屋修繕計劃并組織實施；負責國有資產管理、房地產管理和住房分配；負責財務大檢查；對全院行政后勤工作進行監督指導；負責院機關財務工作。
　　（七）老干部工作局
　　參照國務院部委老干部工作機構的職責開展工作。
　　（八）黨委辦公室
　　辦理院黨委交辦的日常工作；根據院黨委的決定，負責對各研究所黨委的組織建設、宣傳教育、紀律檢查、統戰工作以及共青團、工會、婦女工作進行指導、檢查和協調。
　　院直機關設立機關黨委，與院黨委辦公室合署辦公，根據院黨委和中央國家機關黨工委的部署，負責院屬單位黨的日常工作和思想政治工作。
　　中紀委駐中國社會科學院紀檢組與監察室、審計室合署辦公，按有關規定開展工作。

　四、人員編制和領導職數
　　院機關事業編制為３００名。其中，院長（正部級）１名，副院長（副部級）４名；正副局長３１名（含正副秘書長３名，機關黨委專職副書記２名，監察室主任１名，審計室主任１名）。
　　中紀委駐中國社會科學院紀檢組的編制和領導職數，按有關規定另行核定。