1、主體不同。法人合伙的主體為法人，個人合伙的主體為公民。實踐中，也存在法人與公民的合伙，這種合伙一般稱為混合合伙。

2、對出資的要求不同。個人合伙合同的出資條款即便規定全體合伙人都以勞務出資，也不影響個人合伙合同的成立。而在法人合伙中，出資條款若規定全體合伙人都以勞務出資，將可能由于缺乏固定資產和流動資金，使合伙企業無法正常經營，所以，中國人民銀行《關于搞好資金融通支持橫向經濟聯合的暫行辦法》第4條規定，要保證聯合體有3%的自有流動資金。因此，法人合伙合同中的出資條款應以安排好以固定資產出資和以流動資金出資的比例。

3、法律規定的責任不同。個人合伙，各合伙人對合伙債務承擔連帶無限責任，而類似法人合伙的合伙型聯營企業的合伙人，可以聯營合同中規定兩種責任形式：一是按份無限責任，通常情況下，合伙型聯營企業的合伙人采取這種責任形式;二是在法律有特別規定或合伙人自愿的情況下，采取連帶無限責任形式。在實際生活中，法人合伙聯合體一般都具有成員多、規模大、財產及債權債務關系復雜的特點，因此，一旦聯營企業嚴重虧損，由此產生的沖擊力若通過連帶機制迅速傳導到不同地區、不同部門或產業及不同所有制系統中的成員身上，對經濟生活的破壞作用是巨大的。采取按份責任形式，可緩解合伙型聯營企業破產時對經濟生活的沖擊。但卻對債權人保護不利，同樣對經濟生活程序是個巨大的沖擊!《民法通則》規定合伙型聯營企業，合伙人以負按份無限責任為常態，以負連帶無限責任為例外。但采取按份責任形式會影響合伙型聯營企業的信用，在個別合伙人資力缺乏時不利于對債權人利益的充分保護，同樣對經濟生活秩序是個巨大的沖擊。因此采用這種責任形式有其明顯的弊端。

4、組織管理方式不同。根據合伙的一般規則，個人合伙的每個合伙人都代表合伙執行業務的權利和義務，也可以由各合伙人協商約定或全體合伙人決定，委托一名或數名合伙人執行合伙企業事務。而法人合伙企業由于其成員為法人而非自然人，其具有不同于個人合伙的組織管理形式，從實際情況看，一般采取兩種組織方式：一是規定以各合伙人的法定代表人或其代理人組成合伙企業的管理機構，例如，采取“廠長(經理)聯席會議”之下設立其他專門執行機關;二是規定合伙企業的一切事務均由一名合伙人執行，也即由全體合伙成員推舉一合伙事務執行要執行合伙事務，這種管理方式在組織上往往表現為以一個成員法人為依托，以該法人的經營管理機構為自己的事務執行機構，而不再另行設立聯營企業的執行機關，對于那些以一個骨干型企業為核心，結合若干中小企業組成的法人合伙來說，這種形式有很強的適應性。在技術管理上處于領先地位;骨干企業，通過這種組織方式，可以充分發揮自己的優勢，最大限度克服合伙型企業管理方式上的弱點，從而更加符合社會化大生產的要求，但是，也正是由于法人合伙的業務執行由一個成員法人代行，有時易發生“自己代理”的情況，因此，當代行業務執行的成員法人與法人合伙發生法律關系時，合伙企業的業務執行權應由其它成員法人行使。