當前我國中藥知識產權保護主要有以下八種方式：

一、中藥品種行政保護

為了加強中藥知識產權的行政保護，國務院于1993年出臺了中藥品種保護條例。作為專利法的補充和完善，中藥保護條例是行政法規。中藥保護局限于品種，其保護期限從二級保護的7年至一級保護的10年到30年不等。

二、中藥發明專利保護

中藥的專利保護越來越受中藥企業和研究院所青睞，這既有加入WTO的原因，也與新的藥品注冊管理辦法出臺的三個不侵犯專利條款有關，還與我國新修訂的專利法適度放松對藥品保護有關。

1985年4月1日，我國實施的第一部專利法規定，對藥品和用化學方法獲得的物質不授予專利權。1993年1月新修訂的專利法擴大了對藥品專利權的保護范圍，可以通過對藥品的制備工藝給予中藥保護，發明專利保護期20年。加入WTO后，世貿組織要求我國修改專利法，其中對醫藥知識產權所作承諾包括：降低藥品進口關稅稅率、放開藥品分銷業務、延長藥品專利保護期等條款。因此，中藥專利保護具有強制性，也是國際上認可的法律保護體系，是企業無形資產的組成部分。

三、中藥商標保護

我國加入WTO后，企業自我保護意識加強，崛起了一大批中藥品牌，其勢直逼百年老品牌，顯現了商標品牌的獨特魅力。據統計，連續4年我國國內商標注冊量超過了50萬件，國際注冊商標以年均1000件以上的速度增長，其中以中藥為代表的藥品及其保健品的商標注冊數量占有相當比重。充分表明了企業運用商標戰略保護中藥品牌、實現裂變增長的運作是成功的。

四、中藥原產地、地理標志的保護

地理標志是表明產品原產于某成員國境內某一特定地區，其產品因當地特殊的地理環境、氣候造就了藥材良好的質量特性，如吉林的人參、四川的貝母、寧夏的枸杞、文山的三七等。根據TRIPS協議，要求各締約成員國有義務和責任遵守TRIPS協議中有關原產地保護的條款，同時各成員國還有互認和免檢功能，它是一個國家名優特產品質量與信譽的標志和保證，在進入國際市場上不但擁有特殊的護身符，而且出口還將享受關稅優惠待遇。

五、中藥的外觀包裝設計保護

中藥產品的外觀包裝是工業設計中涉及產品的形狀、圖案、色彩及組合、并富有美感的專業設計。工業設計在專利法中被稱為外觀設計，是對中藥產品的除發明專利、商標以外的另一種保護方式。

六、商業秘密保護

商業秘密是不為公眾知曉、未曾對外公開和披露的信息，我國的反不正當競爭法中有侵害商業秘密權益的條款，它也是中藥知識產權保護的重要方式。包括中藥研發信息、關鍵工業參數、試驗數據、營銷渠道、客戶名單、財務信息等，企業通過實施保密措施加以保護。

七、國家科技秘密保護

關系到國家安全，科技發展和經濟利益的科技成果均屬于國家秘密。中藥產業中的中藥材、中藥制劑配方、主要技術指標、工業路線、關鍵技術均可按技術密級、確定密級時間、保密期限申請，經各級科技部門保密辦公室審查上報，由國家保密辦公室核準即可獲得相應的保密級和保密期限。

八、著作權的保護

企業在文化創建中形成的企業經營理念、宗旨，對外整合傳播的信息，企業的標識、標志、廣告用語、廣告文案，特定的藥品說明書設計等均屬著作權的保護范疇，著作僅屬于版權局管理和授權。