1.影響我國的出口市場。目前中國主要貿易伙伴有美國、日本、歐盟、韓國、東南亞以及中國的香港和臺灣地區，與他們的貿易額占中國進出口總額的85%以上。而這些國家和地區大多數是世界貿易組織“貿易與環境委員會成員”，也是綠色貿易保護主義最為盛行的地區。由于我國長期忽視環保產業的發展，出口產品很難在短時間內達到發達國家制定的環境標準。如果發達國家憑借自身在環保方面的優勢，制定對發展中國家過于苛刻的環境標準，并通過世界貿易組織將貿易與環保緊密掛鉤，這將使我國的外貿出口市場面臨縮小的可能，對我國的外貿出口造成十分不利的影響。

2.削弱我國出口產品的國際競爭力。一些發達國家對我國出口貨物征收綠色關稅和反補貼稅，將使我國出口產品在激烈的國際競爭中喪失競爭優勢。此外，綠色貿易壁壘的制定實施必然會涉及到產品從生產到銷售、使用乃至報廢各個環節的監督和檢測。它要求將環境科學、生態科學的原理運用到產品生產、加工、儲藏、運輸、銷售、使用和報廢處理等全過程中去，從而形成一個完整的無公害、無污染環境管理體系。為達到發達國家的環境標準，今后我國出口產品在流通過程中，不得不增加有關環境保護的檢驗、測試、認證和鑒定等手續及其相關費用。產品的外觀裝演、出口檢驗和廣告等也將作大幅度的調整。這樣，我國出口產品的各種中間費用和附加費用將大幅增加，使產品的出口成本大為增加，進而削弱我國出口產品的國際競爭力。同時，也使我國出口產品的生產企業和外貿企業的經濟效益下降。

3.影響雙邊或多邊貿易關系，引發貿易摩擦。近年來，發達國家以保護環境為名經常采取單方面的貿易措施，限制外國商品的進口，由此引發雙邊或多邊貿易摩擦日益增多。當前世界經濟區域化和集團化趨勢的不斷加強，像歐盟和北美自由貿易區這一類區域性經濟組織的成員基本上都是發達國家，他們的環保水平和環境標準大致接近，個別成員國存在的差距也在趨于協調一致。因此，發達國家可以通過區域自由化貿易的形式，以低于區域環境標準為由，將來自區域以外的產品包括中國的產品排斥在巨大的區域市場之外。隨著世界經濟區域化和集團化趨勢的不斷加強，中國將不可避免地與其他發達國家或區域性經濟組織因為環境問題產生雙邊或多邊的貿易摩擦，影響雙邊或多邊貿易關系，不利于我國外貿的穩定發展。

4.加劇污染產品和污染產業向我國轉移。由于我國環境保護標準低而數目少，環境保護和管理體系不健全，環境保護門檻較低，在發達國家紛紛推行綠色貿易壁壘并日益提高其環境標準的情況下，必然會造成低標準的產品大量涌入我國，洋垃圾進口事件的屢屢發生便是很好的例證。同時，當前我國正處于經濟快速發展時期，需要大量的建設資金，大量外資的流入在很大程度上彌補了我國建設資金的不足。但是，在外商投資建設項目中，我國缺乏對環境因素的評估，對環境影響的評估制度沒有得到真正的實施。一些外商投資者為了獲取可觀的經濟利益和逃避本國高額的成本內部化和綠色貿易管制，將一些污染密集型企業轉移到我國境內生產，這在化工、造紙、印染、電鍍、農藥等行業尤為明顯。污染產品和污染產業向我國的轉移，一方面損害了我國消費者的利益，另一方面，對我國的環境造成更為嚴重的破壞。